La mise en place de la nouvelle gouvernance hospitalière a conduit le Centre Hospitalier  Régional Metz-Thionville à rénover son mode de pilotage interne. La définition des pôles, leurs contours, ont été arrêtés en 2006, et les responsables de pôles désignés en 2007.

L’année 2007 a été déterminante dans la mise en place effective des pôles, structures organisées pour une meilleure prise en charge des patients. 19 pôles ont été constitués : 14 pôles cliniques et médico-techniques et 5 pôles administratifs.
En mai 2007, a eu lieu l’élection constitutive des conseils de pôle avec une participation importante du personnel au vote. Puis, pour chaque pôle clinique, le responsable médical, le cadre supérieur de santé, l’assistant de gestion et un directeur référent ont été nommés en juin 2007 formant ainsi le bureau de pôle qui réunissent régulièrement.
Des réunions de conseils de pôle sont organisées afin d’informer l’ensemble des médecins et personnels des orientations définies.
Dès la fin 2007, chaque pôle a commencé l’élaboration du projet de pôle, document essentiel, dont l’élaboration est un moment fort de la vie du pôle associant tous les acteurs. Le projet de pôle est élaboré sur la base d’un document de cadrage institutionnel reprenant différents aspects (qualité et sécurité des soins, management, …).

Plusieurs rencontres institutionnelles, associant le bureau de l’ensemble des pôles, ont été organisées par la Direction Générale pour faire le point sur l’avancement des réflexions, en présence du président de CME et du conseil exécutif et de la directrice générale. De même, des tableaux de bord multidimensionnels (outils de gestion sur l’activité et les dépenses) ont été fournis aux différents pôles leur permettant d’avoir une vision globale de leur activité.

Aujourd'hui, les pôles sont au nombre de 15 cliniques et médico-techniques et 5 administratifs.